基于細(xì)胞的高通量篩選為什么需要自動化?
【ZiDongHua 之“智能自動化”收錄關(guān)鍵詞:實(shí)驗(yàn)室自動化 HTS工作流程 】
基于細(xì)胞的高通量篩選為什么需要自動化?
隨著研究人員尋求更具有時效性、成本效益和倫理性的動物試驗(yàn)替代品,基于細(xì)胞的模型越來越普及。而且,制藥公司之間尋找強(qiáng)有力的治療候選藥物的激烈競爭需要適合大量分子評估的方法。

在基于細(xì)胞的高通量篩選(HTS)試驗(yàn)中,在培養(yǎng)細(xì)胞中同時評估成百上千種化合物/條件。這些試驗(yàn)的效率和標(biāo)準(zhǔn)化是通過自動化實(shí)現(xiàn)的,特別是通過使用多通道移液頭(MPH)、384/1536孔板和快速分析系統(tǒng)。
基于細(xì)胞的HTS工作流程的主要步驟可分為:(1)細(xì)胞維持培養(yǎng)和擴(kuò)增,(2)細(xì)胞分化/3D形成,(3)化合物處理,(4)樣品制備/活細(xì)胞成像和(5)分析。細(xì)胞的維持培養(yǎng)通常需要每24-72小時干預(yù)一次,以進(jìn)行培養(yǎng)基更換和傳代。必須定期評估細(xì)胞活力和濃度/融合度,以確保培養(yǎng)物的健康,并滿足在不同規(guī)格的培養(yǎng)板中以適當(dāng)濃度接種細(xì)胞的要求。細(xì)胞分化和3D結(jié)構(gòu)的形成需要精確及時地添加專門的試劑和使用專門的實(shí)驗(yàn)室器皿?;衔锾幚硗ǔT趯?shí)驗(yàn)室器皿中以標(biāo)準(zhǔn)SBS格式進(jìn)行,通常為6-1536孔板。為此,向細(xì)胞中加入不同濃度的生物活性化合物(通常使用納升范圍內(nèi)的體積),孵育,然后進(jìn)行qPCR蛋白質(zhì)分析或成像。

盡管基于細(xì)胞的HTS有好處,但維護(hù)和處理細(xì)胞培養(yǎng)物需要專業(yè)知識和時間。多種參數(shù)可以影響細(xì)胞濃度、附著和存活率。此外,基于細(xì)胞的試驗(yàn)通常涉及重復(fù)性操作,且孵育/等待時間較長,因此容易出錯。自動化液體處理設(shè)備在處理細(xì)胞培養(yǎng)物方面具有顯著優(yōu)勢,這得益于工作站中的先進(jìn)技術(shù)和專用軟件。這些自動化系統(tǒng)可以確保精確溫和的吸液和分液、受控的溫度和振蕩,無菌性,以及與第三方設(shè)備整合進(jìn)行自動化分析。
吸液和放液
液體處理需要兩個步驟:吸液和放液??刂坪眠@兩個步驟可以降低細(xì)胞上的剪切壓力和應(yīng)力。自動化系統(tǒng)可以控制各種移液參數(shù),包括:(1)吸液和放液的速度(流速),(2)吸液開始或結(jié)束時吸入的空氣量(吹出量和空氣輸送量),(3)吸液后移液頭在液體中停留的時間(沉降時間),(4)吸液和放液后移液頭移出液體的速度(交換速度),以及(5)吸頭相當(dāng)于孔的位置等。

細(xì)胞培養(yǎng)過程中的一些常見挑戰(zhàn)是對細(xì)胞的干擾(包括在培養(yǎng)基更換過程中的吸液)、接種不均勻和涂層不均勻。吸液和放液可產(chǎn)生應(yīng)激誘導(dǎo)的自發(fā)分化和細(xì)胞死亡。通過調(diào)整移液參數(shù),如流速和吸頭定位,可以顯著降低培養(yǎng)基更換期間發(fā)生這些事件或吸入細(xì)胞的可能性。貼壁細(xì)胞的培養(yǎng)基更換需要以避免吸頭與細(xì)胞接觸的方式進(jìn)行。此外,通常手動傾斜培養(yǎng)板以防止在培養(yǎng)基吸入過程中干擾細(xì)胞。在自動化系統(tǒng)中,專門的傾斜模塊可確保傾斜角度一致,從而提高整個過程中的總體精度。細(xì)胞的接種不均勻通常是由培養(yǎng)基中產(chǎn)生的泡沫引起的,這是由于加入的血清蛋白含量較高。事實(shí)上,在細(xì)胞接種過程中,氣泡可以阻礙細(xì)胞附著,導(dǎo)致細(xì)胞計(jì)數(shù)的孔間差異-特別是當(dāng)考慮96孔和384孔板上每孔生長表面減少時。此外,在培養(yǎng)基分配過程中產(chǎn)生的氣泡會破裂、破壞并可能殺死細(xì)胞,可通過調(diào)整流速、吹出量和空氣輸送量(放液額外吹出空氣量和吸液后額外空氣吸入量)等參數(shù)、使用表面分液和大口徑吸頭以及避免過度移液來避免氣泡形成。圖層不均勻是粘性液體的常見問題,例如用于涂敷3D細(xì)胞培養(yǎng)用凝膠的平板的基質(zhì)。同樣,調(diào)整流速、吹出體積和沉降時間等參數(shù)可以避免此類問題,并確?;|(zhì)均勻分布,從而確保細(xì)胞均勻生長。
無菌性
長期細(xì)胞培養(yǎng)最關(guān)鍵的調(diào)整之一是保持無菌性。諸如細(xì)菌和真菌等傳染源對真核細(xì)胞有害,并最終導(dǎo)致細(xì)胞死亡。此外,即使少量污染也可能導(dǎo)致異常結(jié)果和不正確的科學(xué)結(jié)論。在整個過程中保持無菌可以減少污染的頻率和數(shù)量,減少細(xì)胞、資源和時間的損失。無菌條件可以通過防止病原體通過受污染的設(shè)備、培養(yǎng)基、試劑、培養(yǎng)箱、工作臺以及有缺陷或未密封的細(xì)胞培養(yǎng)容器進(jìn)入細(xì)胞培養(yǎng)物來實(shí)現(xiàn)。高效微??諝猓℉EPA)過濾器和紫外燈現(xiàn)在包括在自動化系統(tǒng)中,用于維持無菌條件以及對平臺和實(shí)驗(yàn)室器具進(jìn)行滅菌。自動化工作流程的手動處理減少也最大限度地減少了污染物的進(jìn)入。
活細(xì)胞成像的整合
當(dāng)貼壁細(xì)胞在培養(yǎng)瓶中的匯合度達(dá)到80%時,細(xì)胞必須消化解離并轉(zhuǎn)移到其他容器中繼續(xù)生長。這被稱為傳代。此外,必須定期監(jiān)測細(xì)胞活力,以確保沒有表型變化。自動化液體處理設(shè)備可以與第三方設(shè)備集成,對細(xì)胞培養(yǎng)物進(jìn)行活細(xì)胞成像。自動成像可以確保細(xì)胞在評估過程中只從最佳培養(yǎng)條件中被篩選。
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